原核诱导表达.docx
原核诱导表达的标准操作程序(SOP;.目的:使本试验室工作人坊了解i先导去达的操作过程,并能实际动手诳展原核诱旧表达-系列试脍.二.适用范围:本SOP适用于对新法因克隆的去达,并针对新舰因产生的可溶性蛋白.三.试验原理:的乳能操纵手含Z、丫及A三个构造基因,分别编码半乳糖伴肺、透油和乙凝基转移前,此外还有一个操纵序列0、一个启动序列P及一个调整班因1。1联因编码种阻遇蛋白,后者与0序列结合,使操板子受阻遏而处于关闭状态.在启动序列P上游还有一个代谢物基因激活蛋白(CAP)结合位点.小P序列、。序列和CAP结合位点共同构成IaC操纵子的网控区,一:个鼠的编码基因即由同一网控区调整,实现加因产物的协调表达,在没有扎糖存在时,Iac操纵子处于阻遏状态。此时,I序列在PI启动序列操纵卜表达的1.aC阳遏蛋白与O序列结合,阳咫RNA景合酹与P序列结合,抑制转录起动.当有乳糖存在时,Iac操纵子即可被诱导。在这个操纵子体系中,英正的法导剂并非乳精本身.乳越进入细胞,经b一半乳精背Ife催化,转变为半乳期.后者作为一种诱导剂分子结合阻遏蛋白,使蛋白构象改变,导致阳遇蛋白与O序列解离、发生转录.异丙基破代半孔楠昔(IPTG)是一种作用极强的诱导剂,不被细菌代谢而特别稳定,因此被试5金室广泛应用.四、试剂打算:(一)试验器材的灭曲:枪头的灭菌:Im1.,2001.201.的枪头放入枪头盒.用报纸包住(2层),放入高压灭菌锅中灭菌,I21C,20min,80C烘箱中烘干,常温放眼。摞口管及肉心管的灭菌:将蝶”管和高心管分别放入铝制饭盒中(盅子要拧松,离心管的管靛翻开),放人高压灭由锅中灭曲,121C,20min.80C烘箱中烘干,常温放置。50m1.高心管的灭菌:将50m1.离心管用报纸包住(2层),放入高压灭菌锅中灭菌,I2IC,20min.80C供箱中烘干,常温放置.(二)1.B培育基的配制液体1.B培H票(I1.):Ifi白珠IOg氯化钠IOg酵母提取物5g调PH(ft到.高乐灭菌.4C保存.固体1.BJSW¼(I1.J:蛋白珠IOg氯化钠IOg酵母提取物5g琼脂粉15g高压灭前,不烫手的状况下参与抗性,抗性:培育型=1;100O(也节,卡那通常浓度),混匀。立刻在无曲操作台中倒平板,并开大风吹干。用封口腴封住,倒置放于4X2保存。()IM1.PTG的配制:经过计算,IOgIpTG可以配42m1.的IM1.PTG,买来的粉末状的IPTG一般全部配成IMIPTG.I、无菌操作台紫外线照镶后通风.2、用少崎去离子水将IPTG溶解完全,并定容。3、在无曲操作台中,用2m的速器将配好的IPTG沌入灭曲后的离心管中,过泄除菌,-20C保存.考前须知:在用谑器珞IPTG注入离心管时,先用针头吸IPTG,然后将枪头拔掉,排出气体,沌头参与IPTG液,花使针管与沌器相连,保证整个装置无气体进入.沌的过程中.手不他碰漉头.(四)3SDSMGE1.oadingbuffer的配制:3×SDS-I½GE1.oadingbufferIOmIIMTris-Hc1.(PH6.8)SDSBPB(洌酚收)30mg甘油(丙三丁)3m1.去商子水1 .将除BPB以外的药品完全溶解.SDS常温下很难溶解,可以在37C水溶溶解.完全溶解后,再参与BPB进展溶解,2 .把溶好的buffer分装到的离心管中,InW管,常温放汽,3 .运用前,W参与301.装将乙卷.考前须知:软基乙酹为危急品.参与的过程在通风枷中完成,弁且带好手套,()IOXPBS的配制:PBS(IOxPBS)I1.NaH2PO4JH2ONac1.85gNa2HPOi.12H>O用去肉子水将以上药品进展溶解。(溶解的特别慢,可能须要过夜)周PH值到,用的灌膜过液.常讯保存.工作时用的是IxPBS.(六)Tris-Hc1.(PH8.8)的配制:Tris-Hc1.250m1.Trisg1 .用20OmI去禺子水将TriS溶解。2 .用浓盐酸冏PH值到.3 .调好PH的Tris-Hc1.定存到250m1.4 .的沙膜过谑,常温保存。考前须知:TriS的缓冲实力彼强,调PH值时,费些时间,但不要调过.3.调好PH的TriS-HC1.定容到250m1.4.的渔膜过谑,常温保存“(八)30%丙烯酰胺的配制:30%丙烯眦胺250m1.丙烯酰胺72.5m1.BIS卬叉丙烷配胺2.5m1.1.把药品用去黑子水溶解后定容到250m1.2.用泌纸过逑,放在棕色粒子中,4C保存.考前须知:两种药品有以性,配制过程要带手套和口罩。5 九)10%SDS的用制:1 .IgSDS参与IOmI去离子水进展溶解2 .分装到离心管中,-2OC保存。(十)10%过硫酸僮的配制:1 .Ig过破酸皱参与Iom1.去离子水进展溶解,2 .分装到离心管中,-20C保存。(十-)5xSDS-PAGE电泳缓冲液的配制:5×SDS-PGE电泳谖冲液I1.TrisGIyCinC:甘刎酸)94gSDS5g将以上药品用去高子水溶解后定容到I1.-常涉保存.工作时用的是IXSDS-PAGE电泳缓冲液。(十二)考/斯亮蓝R-25O染色液的配制:考乌斯亮蓝R-25O染色液I1.1 .往Ig考马斯克i½R25O中参与25Om1.异丙醉,在破力搅拌器上搅拌六小时以上,2 .参与65OmI去离子水,破力搅扑器挽扑过夜,3 .再参与100m1.冰型酸进展溶解.极力挽抨器搅摔.4 .在通风橱内用谑纸进展过酒.常温保存.柒色液只能反究用两次“考前须知:在疏力搅拌器上搅拌时,要把容器封口。(十:)脱色液的配制:脱色液I1.除酸(冰乙酸)100mI乙醉(无水乙肿)50m1.去卷子水850m1.常温保存.四.试验步骤:(一):质粒的转化I,运用无储操作台之前先用75%的酒精擦拭,然后将灭曲的培H柜以及全部要用到的器具放到超净台上,在开紫外照楸30min左右.操作之前,关掉紫外,翻开通风树,将手用酒精擦拭后开场操作.2 .从-8(FC的冰箱中取出表达菌(B1.21)的感受态细胞(每管1001.),ft-80冰水中溶化.3,载体(PET32a等)与基因片段的连接后期粒1.1.媛慢的参与到1001.B1.21感受态中.冰置15min.(无菌操作)3 .42C下热激90s,的后在冰水中冰置5min.4 .涂板:先将涂布棒用酒精棉球擦,然后用酒精灯火焰烧,放汽等它凉却.把处理后的感受态点在含有抗性的固体培育葩(定带或卡那等)上。用冷却的涂布棒进展涂布,左手把该盖拿起,小指轻轻也动培讦基,右手来涂,涂到培育基外表快干。(无菌操作)5 .放在37C培育箱中,例置培育过夜。考前须知:1 .质粒的转化时.防粒是冻在-20C的冰箱中,等它完全化了在进展吸取.往好受态中参与项粒时,肯定要缓慢,因为感受态特别脆弱,防止通受态受伤.2 .质粒的转化时,热激的时间90s,肯定要限制好时间。3,质粒的转化时,涂布棒在涂布附,泞定要晾凉涂布棒”防止呼受态被烫死,或冏体培存基的损坏.(二):挑薄与接曲:1 .无菌操作台紫外线照辘.后通风.符转化后的平板取出.2 .在无菌操作台中,把消毒后的螺口管(一般一个基因取四个螺n管,展平行试验)取出,在酒精灯的外焰上灼烧螺11管管口。3 .火苗格的1.B培育基从冰箱中取出,在酒精灯的外馅上烧一下培育翦瓶口.吸取1.B培育基(Tftm1.)参与摞11管中.后参与抗性(氨不客素、卡那等).显苇霉索(卡那):1.B培百基=1.1.(XK)(1.),抗性由教体确定.4 .镣子用酒精槌球擦拭,并在酒精灯的外焰上灼烧,将镣子脱凉,用脱冻的铅子,夹取2O1.小枪头,在转化后的平板上挑取单曲落,扰到培育基中.5 .接好菌的端口管.进展摇菌.37C.180rpm,摇到菌的对数期(0。,帆低),时间也许2-3h可以模相看到手即可.(留意不要摇过)6 .用完的平板用时口服时住,倒置放于4C保存。7 .假设干脆用曲液进展接茵,接阳比例为,阳液:1.B培育域=1:100,考前须知:1 .接倒吸培H脸时,把放芭培闩基的三角就倾斜才吸取培白班,移液枪屋眼不要插进三角械中.2 .接函时肯定要参与抗性.挑曲落时.要挑单个的菌落.且不要把培育基也扣起来.3 .摇带不要过了它的对数期,2小时后随时留意其生长状态。(=)小量保菌:1 .无菌操作台紫外线照耀.后通风.2 .将擢到标准OD值的储液进展小演保的,先在酒精灯的外焰上灼烧蝶口管管口.3 .保萧:从灭菌的饭盒中取出4个的灭菌的离心管,参与501.的灭曲后的80%的甘油,并分别参与相应的350P1.菌液.一个基因的四个平行试验菌都要进展保苗.(假设不保苗,试验不能进展更复,只能从头做)4 .标消保郎的类别,名称,时间,如“B1.21PET32aVAV1号20211其中的1号是平行比照中它排几号.5 .混匀.-20C保存.考前须知:1 .在小境保阳中,一个基因的四个平行比照都要保储,否那么得重新换条件。2 .在小量保菌中.菌液与甘油肯定要混匀在保存,有那么菌会被冻死.(四)IS白诱导衣达条件摸索1 .无菌操作台紫2 .小盘保窗后的下进展i秀呼(如下列图外线照耀,后通风.四个平行试验组,分别参与不同终浓度的IPTG在不同的诏度条件):比照编号IPTG终浓度疏导温度诱导温度1号1mmo!1.3h37C2号mmo1./1.3h37-C3号Immo1./1.3h30C4号m111.1.3h30,C(£)小量收曲1.将诱导完成的四个平行试脸组菌液,分别取HZm1.对应装于4个不同的离心管中并做好标记。剩余的平行试蛤祖带液放入4C保存。2.离心7000rpm.2min.使储沉淀.3.把上层培育基倒掉,用Im1.IXPBS把表达曲重昼,再次离心700OrPm,2min,使曲沉淀.4.把上层IXPBS倒掉,再次离心同步嶷3.5.用801.IxPBS把表达斯体重悬,6.在四个平行的垂悬液中,分别参与801.3×SDS-PAGE1.oadingbuffer,(把3×SDS-PAGE1.oadingbuffer当成2xSDS-PAGE1.oadingbuffer用)7.煮样8min.(糊开锅之煮)8.离心1300OrPm,IOmin,吸上消.9.迸展SDS-PAGE电冰。考前须知:在点样时要胡开锅孟煮,防止小样进水,解设样进水,那么不能再用.(六)SDS-PAGE胶的配制1 .别肉股的配制(I)找出配套的胶板,用擦镜纸擦干冷,井也1定在配股器上,后用去离子水试漏.(2)假设胶板不漏水,就进展别离收的配制,依次将水、30%丙烯酰胺、Tris-Hc1.()、10%SDS.10%过破酸侬加到干净的小烧杯中(如下列图),混勾。(Imm的胶板,一般限一块股用5m1.所配的胶浓度一般为12%,但浓度也要视状况而定.蛋白越小,股的浓度越大.)SDS-PAGE分离胶配方表0、GH3O30%Ayi11¼3!.5MTHC<c*<1.10S0Sg七班MTBMeDroHQ30A><am1.5MTn*0(oK8SSDSTEMED%3NiO30SACrytWTe15UTfHgMIOSSOS件煤加集TEMED12MMiO30%AWr3f“UYnt*cgaIOSSOS10%TEMED19%OMXQ30SACr561.65w11C>X1.!OSSOSw%emaTFMFD3333,00321100o30300150.1500126940380150.150009S950380150150006Ie6002JO1.10.4&Ooo.6O0220663oo.a6O029«ft46.o062Q,3aag1356OOO3B3有余166000S3JX*I19660002Q32sa16W60OO7SJNK3580OO1596075。303002413980750303001811910075030)0.012120030300121507603030012212ao10004040032Ig10710004040841S913310004040016132160100040400i92200WO0404001650555261012。23555打1312o87555M962000111SOSSSM(3)构胶板中的水倒掉,并用海纸吸干水分(不要将灌纸塞到胶板底部).(4)小烧杯中再参与TEMED,混匀。(TEMED可使胶凝固,所以最终加)(5)灌胶:混匀的别离胶沿着胶板边缘轻轻灌卜,防止产生气泡。(6)用水将别离胶压平(用水淞满,同时加水时要缓慢参与,防止把股吹起)2 .浓缩股的配制(1)待别离肢与水中间形成明显的横线,即别离皎凝固。防后进展浓缩胶的配制,依次将水、30%丙烯酰胺、TriMHCI()、10%SDS.10%过硫酸快加到干净的小烧杯中(如下列图)SDS-PAGE浓缩胶(5%ACn1.amide)配方表香F怡号"皎体飘及断G忖,&瞥,*材,1m1.2m1.3m1.4m1.H>Oo1421273441556830%AcryOmia90170330807OWVO13171.0MTri4<1.(pXS>0.1302SC38050630.7510125IOa-SOS0010020030040C60060801Iosaeurs0.010020030040060060001TtMtO08100C20003OOCM00050006ooce001(2)将别岗Q2上层的水例抻,并用泄纸吸干水分,(尽量不要把港纸插入)(3)小烧杯中再参与TEMED,混匀.(4)港股.然后捅入梳子。(5)把制胶器倒过来,股仍用不会往外流,或可以明显看出核子中两个齿之间的股面明显凹下去,说明浓缩胶凝固.将凝固的胶板装入电泳槽内,并在电泳槽内参与SDS-PAGE电泳馍冲液,把胶浸泡一段时间,时间越长越好。(防止梳子与股相连,或胶因湿度不好而萎缩)点样时,一把,子拔出来,拔时动作要轻,防止股齿被拔断.(七)未诱导和空载的制得在饯导表达中,有两个重要的比照组,即空载诱导和未诱导1 .未诱导的制备(1)未i导是我们所做1个法因除了四个平行试验外,再做的一个比照祖曲,唯一不同的是它不进展诱导(接菜步骤如上),在37TCK.进展摇的,不加IPTG,摇起来即可.(和表达完的茵浓度差不多即可)(2)未诱导的菌进展小量处理,见上面的小1收菌.2 .空我诱导的制备(1)空载的转化:将不连基因片段的空载体质粒.转入表达菌(和前面的试验用一个表达萌),如“B1.21-PET32a-VAV质粒”转入"B1.21友达陆",其空载应当是“B1.21.-PET32a”转入"B1.21表达曲”。转化步骤同上。(2)空载接一个黄(试粉组),并摇曲摇到对数期(步赚同上).(3)空载的诱导:空统的诙导条件固定为温度37C,时间3h.,IPTG终浓度为Imm<1.诱导步骤如上).(4)空载的曲进展小量处理,见上面的小埴收曲。(八)蛋白诱导表达条件摸索的SDS-PAGE电泳1 .拔掠SDS胶上的梳子,并用小针调整齿的位置(使它们都平行)。2 .点样。用2(1.的小枪头,吸煮过的样品1.O1.,而准胶孔点样,用意不要把样品点在外面,我们用的marker是低分子量蛋白marker.一般由点样依次是:1234567空栽未诱导样品I号样品2号样品3号样品4号marker3.开场电泳,电泳文正负极接好,翻开电源,浓缩胶:电JQ1.ow100V别离胶:电压high150V.4 .州胶染色.等胶内的全部的蓝色都跑出去.电泳停蟆.一般时间为1小时45分.把胶板从电泳仪上卸下,用刀片把胶板撬开,胶的浓缩股局部割除.放入考4斯亮蓝R-25O锹色液中进展常温过夜染色,5 .脱色。将过夜染色的SDS-PAGE胶放入脱色液中进展脱色,耳到背景发白。(九)四个平行试验组菌液的选择1 .将脱好的股京H1.进展视察,看四个平行试验如菌液是否进展了蛋白表达,一般来说,未诱导没有过量的蛋白表达,而空载有一处蛋白的过他表达(大小由表达战体确定),四个平行试5金组也有一处蛋白的过豉表达.它比空载表达的蛋白要大,大出的那一局部即我们的目的蛋白.2 .假设平行试设平中无过最皈白表达,尤其是37。ImmO1.1.,3h无过量蛋白表达,那么说明蛋白无表达.3 .假设平行试验组中行过量蛋白表达,但它的大小与空教的大小一样.这说明蛋白进展了漏发达.4 .假设蛋白表达正常,那么选择诱导温度最低IPTG浓度最低的试验组(30C,0.1mmo1.1.3h),进展下面的小麻超出试验.(I)表达阳的小境超声试验1 .把以上做的四个平行试5金组菌液从4七中案出.2 .将最有条件的试验前全部收集在的小离心管中.(其他平行试验组的菌进展灭菌)3 .离心700OrPm2min,使菌沉淀,4 .把上层培育基倒掉,用ImIIXPBS把衣达曲重悬,再次离心700OrPm,2min,使曲沉淀5 .把上层IXPBS倒被,再次离心同步骤3.6 .用500M1.XPBS把表达的正悬。7 .将菌液放入小玻璃管中,打算进展超声。8 .将超声仪物开预热20min,并打算冰盆.9 .翱呈菌液的小玻璃管放入冰盒进展超出,超出效率为3050HZ.超出3s,停5s.直到倒液超澄清(透光呈现鸡蛋消色)10 .将超开的阳液进展离心,130Oo1.Pm,10min.11 .肉心产物上清取出1001.1001.3XSDS-PAGe1.oadingbuffer.12 .上消倒掉,沉淀用Im1.IXPBS把表达菌更悬,再次离心1.3000pm,IOmin.13 .重:复I1.步.14 .上清伊厢,用Io(HI1.将沉淀悬起,金与1001.3×SDS-PAGE1.oadingbuffer>15 .上消和沉淀都进展煮样.开锅盅,Smin.16 .惠心13()0OrPm.IOmin,吸上酒.17 .进展SDS电泳。考前须知:1 .小样超出时,要树彻底,一般超45分钟即澄清.假设仍旧不澄清,那么可能是包涵体,超的过程中不要出糊.2 .在洗超声离心物的沉淀时,要洗干净.(一)被南闻声的SDS-PAGE电泳1.配股、点样、电泳的步骤如上。破倒超声的点样依次一般为:!23456marker未选导空投全苗破面上消破苗沉淀未疏导.空投,全苗为摸索友达条件时所用的样M.注:我们破的几号笛,就上几号的全曲样e2.假设破南上消表达的蛋白与全菌的蛋白分子盘一样(目的蛋白),且破的沉淀中没有,这说明蛋白可溶:假设破菌沉淀中书"目的蛋臼,而破面上清中没有,说明蛋白为包涵体.(卜二)目的蛋白的大量表达(I1.)1 .配制培育基11.,每大瓶500m1.高压灭菌4匕保存.2 .一彼接曲:摸索完条件的衣达菌进展接菌3管,每管5m1.,抗性:培育基=1:1000,储液:培育携=1:100(阳液为针对可溶条件的小飞保带液)步骤如上。37X:,120pm,过夜播黄。3 .标准保菌:1<K)I1.1.灭菌甘油参与701.过夜菌.混匀-20C保存.(写好名称H期.如上.放入表达函的库中)3 .二级接菌:对大Si进展接菌.抗性:培育基=1:1000.衡液:培育基=1.I(X).即每瓶5m1.4 .37。ISOrpm,摇到对数期,摇到黄的对数期(OD6x.值).时间也许2-3h.可以模糊的看到手即可.(曲意在播过程中的时视察状态,不要摇过)5 .诱导:依据揍索好的条件进展诱导.(IH)大量诱导的收箔:1 .50m1.黑心管灭菌烘干待用.2 .找出两个50m1.离心管,管和管我上做标记,并称量.3 .6个50m1.离心管(包括称虫的两个),例入苗液(40-45m1.).配平,离心700OTm,IOmitu4 .倒掉上清.ffIXPBS把菌重悬.离心700OrPm.IOmin.5 .曲狂4.6 .倒掠上济,称菌体的!R;*,7 .慈曲,Ig曲体参与35m1.的纯化时用的上样镶冲液悬起,-20C保存.(十四)大量表达曲的胡省1 .把表达曲从20C拿出,在流水中溶化,2,把完全溶化的表达曲,放入小烧杯中打算超声,3 .将超声仪翻开预热20min,并打尊冰盒.4 .将呈菌液的小烧杯放入冰盒进屣超声,超声效率为30-50HZ.超声3s,停5s.宜到雨液却澄清,呈现两景清色,1一般曲2O-3Omin,用意不要吵时间太长,使茵超糊)5 .将超开的菌液进展国心.1300OrPm.IOmin.6 .将上法收集在灭菌的50m1.离心管中,进展纯化.Ii.促进原核表达的蛋白可溶的方法:一般来说,人们认为包涵体的形成是因为新生多肽鞋不能在正确位置形成二破世,二碗出错用.进而错误折比的结果,而IPTG浓度越低,温度越低.般蛋白的可溶性越大,因为这样的条件下,可以减慢柒白的形成,削减蛋白的:能键错配,从而促进蛋白的可溶。1.使蛋白可溶的条件并不是冏定的,一般来说,以上条件就可是蛋白可溶(有时2/4条件可以把IPTG浓度提的高一点),但假如仍不行溶的话,可以试一下.常温.过夜诱导。这种条件是IPTG运用法的燃小浓度,可以使包涵体局部可溶,2 .18OrPm摇曲摇时数时,不要摇过。对数期时,是表达诂产蛋白的呆正确时期,表达南浓度太大,对菌中蛋白的可溶性影响会很大.所以在摇菌到2h后.肯定亲密关注菌的浓度,随时用分光光度计测ODMW值.这就意味着在接雨时,多接一些菌(由实际状况而定).3 .蛋白的可溶与表达翦也有关系,菌株内源的蛋白册过多.可能会造成外源表达产物的不稳定,所以一些蛋白版缺陷型菌株往往成为志向的起始友达菌株.堪称羟典的BI.2I系列就是Ion和OmPT蛋白前缺陷型,也是我们特别熟识的表达苗株,大名船招的B1.21(DE3)融滁菌那么是添加T7聚合酹基因,为T7表达系统而设计。B1.21(DE3)即我们做表达T常用的表达菌.其核细胞偏优的密码子和原核系统有不同,因此,在用原核系统去达观核基因的时候,真核那因中的一些密码子时于原核细胭来说可能是稀仃密码子,从而导诙表达效率和表达水平很低.改造域因是比拟麻烦的做法,Rosetta2系列就是更好的选择一一这种携带pRARE2质粒的B1.21衍生菌.补充大肠杆菌缺乏的七种(AUA.AGG.AGA,CUA,CCC1GGA及CGG)稀有密码子对应的RNA.提岛外海基因、尤其是比核基因在原核系统中的表达水平。(己经携带有乳客素抗性质粒)当要表达的蛋白质须要形成:破键以形成正确的折段时,可以选择K-12衍生曲Origami2系列,Ihiorcdoxinreductase(trxB)4)g1.utathionereductase(gor)两条主要红原途径双突变断株,显著提高细胞质中二硫迸形成几率,促进蛋白可溶性及活性发达.(卡加毒素敏博)Rosetta-gamiTM2那么是媒合上述两类菌株的优点,既补充7种稀有密码子,又能够保进二硫母的形成.帮助表达须要借助二城犍形成正确折变构象的真核蛋白.(卡那毒素敏感)OrigamiB是衍生自IaCZY突变的B1.2I菌株,这个突变能依据IPTG的浓度精确调整衣达产物,使得表达产物量呈现IPTG浓度依野性.(四环洪敢感)在确定试用这些名字乖僻的菌株时.有几个小TiPS是要留意的,一个是不同菌株有时已钱携带某个质粒或者已经具有某种抗生素抗性,要留意自己的表达质粒是否能与之iT容,比方ROSeUa2©经携带行公毒素抗性侦粒,不能再用短都素筛选等等。现跳可能螺由改良方案建议株无蛋白表达E.Co1.i的密码子偏移性补充赫有密码的IRNA;将稀仃密码子突变为一般大肠杆曲密码子RoscKa2Roset(a-gami2Rse1.1.a-gamiBRoscttaBIuc出现截短蛋白包涵体二破键形成困班降低宿主胞质的复保性:利用促诳二硫谨形成的各种载体标签Origami2Rosct(a*gami2Roseua-gamiB表达过快表达量过高限制优化表达水平:降温IPTG浓度优化TunerRosetta-gamiB蛋白无活性蛋白错误折挣降低宿主胞防的复原性:利用促迸二硫犍形成的各种栽体标程Origami2Roseua-gami2Roseua-gamiB限制优化表达水平:降温,IPTG浓度优化TunerRoseUa-gamiB细胞死亡,生长极困难毒性蛋白更产格的本底表达限制p1.ysS菌株无克隆生长过商木底表达更严恪的本底表达限制p1.ysS>P1.ySE倒株4.假设实在不行溶,只能把蛋白截短,这样可溶性会明显增加.六,SDS-PAGE的相关技巧:1. SDS-PAGE电冰的原理:SDS-聚丙笳酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯Itt股凝胶系统中引进SDS(十二烷基酸酸钠),SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的累几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽友合物在内税悔胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在到达饱和的状态下,每克多肽可与去污剂结合.当分子辰在I5KD到200KD之间时,蛋H质的迁移率和分子累的对数呈线性关系.符合下式:k>gMW=KbX,式中:Mw为分子般,X为迂移率,k、b均为常数,假设将分子地的标准蛋白质的迁移率对分子量对故作图,可获得条标准曲城,未知蛋白质在一样条件下进展电泳,依据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求科分子Tia2. SDS-PGE电泳遇到的相关何胭及解答,(1)配股缓冲液系统对电泳的影响?在SDS-PAGE不连续电泳中.制胶缓冲液运用的是TriS-HC1.线冲系统,浓缩胶是,别离胶;而电泳谖冲液运用的TriS一甘敏酸缓冲系统。在浓缩股中,其PH环境早.弱酸性,因此甘氨酸解肉很少,其在电场的作用下,泳动效率低:而C1.离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动.由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋向质分子聚集铛一起,浓缩为一狭窄的区带,当样品iS入别离胶后,由于胶中PH的增加,呈碱性,甘朝酸大琏解离,泳动速率增加,干脆紧随氧离子之后,同时由于别离胶孔径的缩小,在电场的作刖下,蛋白分子依据其冏有的带电性和分子大小进展别国.所以,PH对整个反响体系的影响是至关重要的,试验中在解除其他因素之后仍不能很好解决问咫的状况,应首要考虑该因素。12;提高SDS-PAGE电泳辨别率的途径?聚丙烯Itt胺的充分聚合,可提岛凝胶的辨别率.建议做法:待凝胶在室温凝囿后,可在室温下放置段时间运用,忌即配即用或4度冰箱放冏,前者易好致凝固不充分,后者可导致SDS结品。一般液胶可在室温下保存4天,SDSUJ水解聚丙烯酰股.(4) “澈笑”(两边翘起中间凹下)形带缘由?主要是由于凝胶的中间局部凝固不匀称所致,多出现于软厚的凝胶中。处理方法:待其充分邀囚再作后续试验.(5) “皱眉.(两边向下中间鼓起)形带缘由?主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未解除干净.处理方法:可在两板间参与适量缓冲液以解除气泡.(6)为什么带出现拖足现象?主要是样品融解效果不佳或别离肢浓度过大弓I起的。处理方法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品便溶剂:电泳缓冲液时间过长,重新配制:降低凝胶浓度.(7)为什么带出现纹理现象?主要是样品不溶性颗粒引起的.处理方法:加样前禹心:加适盘样品促溶剂。(8)什么是“鬼带",如何处理?“鬼带就是在跑大分子构象困难的蛋白质分子时.常会出现在泳道顶端(有时在浓缩收中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于亚原剂在加热的过程中被乳化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子常新折郎结合和亚基更新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入别图股.但它却于目标条带有一样的免疫学活性,在WB反响中可见其能与目标条带对应的抗体作用。处理方法:在加热沸3M添切透盘的DTT或BeIa筑基乙H?.以补充映乏的复原剂:或可加适hiEDTA来阻档史原剂的氧化.(9)为什么漠酚减不能起到指示作用?我们在试脸中常会遇到双的蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象.主要与缓冲液和别离胺的浓度有关.处理方法:更换正确PH值的BUffer:降低别离股的浓度,(10)为什么电泳的条带很粗?电泳中条指很粗是常见的事,主要是未浓缩好的经由,处理方法:适当增加浓缩股的长度;保证浓缩胶贮液的PH正确();适当降低电压,